jeanjack/introlinux
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jeanjack 2024-12-06 14:03:33 +01:00
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README.md
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@ -22,7 +22,7 @@ Le shell est une interface utilisateur purement textuelle et qui s'utilise uniqu
Dans un environnement graphique ( sur un P.C par exemple ), on ouvre un terminal pour avoir une fenêtre contenant un shell. Dans un environnement graphique ( sur un P.C par exemple ), on ouvre un terminal pour avoir une fenêtre contenant un shell.
Cet interface permet d'invoquer le logiciel à utiliser, et adapter son comportement sous la forme d'instruction. plutôt que d'ouvrir un navigateur de fichier (GUI) , aller cliquer dans chaque répertoire, pour enfin double cliquer sur le fichier fasta voulu afin de l'ouvrir, on peux le faire en shell de cette manière : Cet interface permet d'invoquer le logiciel à utiliser, et adapter son comportement sous la forme d'instruction. plutôt que d'ouvrir un navigateur de fichier (GUI) , aller cliquer dans chaque répertoire, pour enfin double cliquer sur le fichier voulu afin de l'ouvrir, on peux le faire en shell de cette manière :
`more /etc/passwd` `more /etc/passwd`
@ -107,7 +107,7 @@ NAME
J'ai passé le résultat de man head (normalement affiché sur la sortie standard) dans l'entrée standarde de head, qui m'affiche uniquement les 5 premières lignes. J'ai passé le résultat de man head (normalement affiché sur la sortie standard) dans l'entrée standarde de head, qui m'affiche uniquement les 5 premières lignes.
Passons aux choses intéressantes : voyons plutôt sur le fichier fasta comment compter le nombre de séquences : Passons aux choses intéressantes : voyons plutôt sur le fichier comment compter le nombre de lignes :
Vu qu'on veux récupérer le nombre de séquence, on vas filtrer le contenu du fichier pour n'avoir que les lignes contenant un chevron : Vu qu'on veux récupérer le nombre de séquence, on vas filtrer le contenu du fichier pour n'avoir que les lignes contenant un chevron :
``` ```

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diapo.md
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@ -203,8 +203,8 @@ On va voir l'utilité de grep
- grep avec -A 1 affiche 1 ligne de plus a chaque \"match\" - grep avec -A 1 affiche 1 ligne de plus a chaque \"match\"
Plus intéressant : essayons d'afficher le nombre de séquences sur le Plus intéressant : essayons d'afficher le nombre de séquences sur le
fichier fasta. On va tout d'abord utiliser grep pour n'afficher que les fichier. On va tout d'abord utiliser grep pour n'afficher que les
lignes comprenant un chevron lignes comprenant le texte : root
::: :::
::: frame ::: frame